生命早期发生过敏性疾病，预示以后罹患哮喘、过敏性鼻炎的风险增加(两倍)。生命早期发生牛奶蛋白过敏，是未来功能性胃肠病的危险因素。
牛奶蛋白过敏的发生率大约0.83%——3.5%。功能性胃肠病的发生率大约50%。
单纯只有消化道症状，可能只是功能性胃肠病，而且大部分孩子应该是功能性胃肠病，一看到消化道症状就要求母亲忌口、宝宝忌口回避各种蛋白质实在不是明智之举。
区别于功能性胃肠病，牛奶蛋白过敏，与月龄没有相关性，除了有消化道症状之外，还有皮肤、呼吸道、神经系统的症状，会伴随喂养困难，可能出现生长发育迟缓、呕吐、便血等等。
如果激发回避试验阳性，确诊为牛奶蛋白过敏，建议饮食回避6-9个月或者更久。只有50%的牛奶蛋白过敏的孩子在1岁时可以耐受牛奶，大约90%的牛奶蛋白过敏的孩子在3岁时可以耐受牛奶。
牛奶蛋白过敏的孩子，换了奶粉之后，症状虽然缓解，可能体重增加依然不太理想。
乳糖不耐和牛奶蛋白过敏，这两个问题很可能出现在1岁之前。
